При импорте давишь галочку "сиквенс" - и импортируется клип-последовательность. Или, если в папке с просчитанными кадрами нет посторонних файлов (не относящихся к сиквенсу), берёшь папку в эксплорере и кидаешь её в окно проекта. А вообще к АЕ есть очень толковый хелп.