Почему тебе не помогает удалить историю? попрубуй всё же действительно её удалить и не будет проблемы с наследуемыми трансформациями.
Ну а так если НАДО сохранить историю и вылечить твою группу, то в Гиперграфе выведи геометрию - увидешь всю "входную" геометрию в одном месте и её легко будет собрать в отдельную подгруппу. Если отключить только у этой группы inherits, то это распостраниться на всё её содержимое, но правильно - вобще вытащить её из основной группы.
Так нужна ли тебе история? Удали её правильно и делу конец.