Блин, я же сказал - делаем Индекс в ИнДизайне, с номерами страниц.
Потом уже в Ворд, чтобы расставить по алфавиту.
К тому же бывает полезно избавиться от ИНДЕКСА в ИнДизайновской книге, поместив туда указатель просто как текс из букв и цифр.
Может быть, в ЦС2 исправят этот косяк, но пока индекс отчаянно тормозит в больших публикациях, где по идее он особенно нужен.
Может быть, сработает вариант, что предлагает Hoar, попробуй.