Прикольная задачка
вообще текстовый формат файлов майя(*.ma) на мой взгляд должен всеми майями читаться хоть для линукс хоть для выньдоус потому как там просто команды для майя не привязанные к операционке и бинарному формату. наверно могут возникнуть проблемы с именованием папок потому как в линуксе они наверно имеют не такие пути как а выньдоус.
К сожалению, под линукс еще не программировал, хотя было бы интересно.
Хотя это может и не понадобиться если текстовые файлы *.ma из линукс и виндоус конвертить в среде windows