Префсы это настройки (Preferences), есть еще и персональные настройки если чё менял. Из меню Window>Settings/Preferences>Preferences...
А все это сохраняется в папке:
напр у меня: Мои документы/maya/
вот там все префсы, есть и папка prefs, попробуй сначала снести все что там есть, но незабудь зврезервировать.