Насколько я понимаю, больше всего отягащают файлы - полигоны...
Если тормоза возникают во время моделлинга, то помогает скрывать некоторые объекты, которые особенно хорошо прорисованы (т.е. имеют много поликов).
скрывай не скрывай, а сохраняется все равно в один файл, просто постваь галку в Preference -> File Compress on Save
тогда размер файлов значительно будет меньше, хотя если жать нечего, то и размер файла, соответственно, будет не сильно отличаться