При встраивании T1 в PDF шрифты перекодируются. Доходит даже до того, что кириллица представляется двухбайтовыми символами (см <Ctrl> + <Alt> + <F>) — точно также, как это происходит с CID-шрифтами: японским, китайским и т.д. «Под раздачу» достается и латинской части шрифта, т.е. при попытке открыть такой PDF с помощью AI мы увидим точно то же, что произошло бы, будь в PDF'е не кириллица, а «японица». То есть ничего утешительного. Сохранив страницу как EPS (File > Save As в Acrobat'e) со встраиванием шрифтов и посмотрев затем содержимое EPS'а, можно увидеть, что текст состоит из двухбайтовых символов — и латиница, и кириллица. Причем первый символ обычно \000.
Возможный выход из этого — попытаться не открыть PDF в AI, а передать страницу из Acrobat'а на редактирование в AI с помощью TouchUp object tool'а (черная стрелка, <Shift> + <T> в Acrobat'e):выбрать этот инструмент и в меню по правой кнопке выбрать Edit page…
Кстати, InDesign 2, несмотря на то, что с кириллицей он работает хорошо, таки воспринимает ее как …japanese-font: File > Package и View Report
