Попробуй загрузить fbx сделать масштаб сцены допустим в метрах (или какая-там в webstorm) и экспортировать fbx.
У тебя получается webstorm читает 10мм твоего fbx, как 10 метров. Соответственно нужно, что бы твои 10 мм, стали 0,001 метра, поэтому, мне кажется нужно поковыряться с настройками масштаба, может у вас там что-то не так.
Посмотреть вложение 281784