Мет`ода скрипта такова, что им очень удобно автоматизировать рутинную работу..
Если у тебя алгоритм действий одинаковый, то можно написать скрипт, который будет открывать/импортировать файлы, и с каждым из них проделывать определённые манипуляции (добавлять.удалять модификаторы на объекты, трансформировать их и т.п.) а потом сохранять каждую сцену с изменениями...