Mpeg 4 это и есть один из форматов представления avi-файла. Так называемый "кодек". Не столь важно, какой софтиной пользуешься, важнее грамотно поставленные настройки самого кодека. Кстати, вышла уже версия "4 релиз" - хренова гора настроек в отличие от более старой версии "3.11 альфа релиз".
Я пользуюсь, как правило, VirtualDub-ом.