А каким способом ты пробовал?
Я открывал Кварковские документы в InDesign CS, отлично выходит. Однако гемора по чистке потом много. ИМХО, проще из Кварка в РТФ текст, потом заново в ИнДизайне сверстать. В слечае с книгой выходит хорошо - текст себе и текст. А если, к примеру, журнал с кучей маленьких статеек и оргомным кол-вом фоток... Не знаю, открывать тогда и чистить.