Нужно написать скрипт, который строит 3D модель по алгоритму.

По варианту входного кода нужно повернуть очередной элемент на соответствующий угол и присоединить к предыдущей конструкции.

Упрощённый вариант скрипта уже написан:

(
dataFiles_arry = #()
dataRaw = #()
kk=#()
pro=#()

rootFolder = getFilenamePath (getSourceFileName()) -- определение корневой папки данных по положению .ms файла

if rootFolder != undefined then dataFiles_arry = getFiles (rootFolder+"\\Composite9\\*.txt") --определения файла .txt в папке Composite9
if dataFiles_arry.count == 1 then --если .txt в папке 1 то
(
dataRaw = (dotnetclass "System.IO.File").ReadAllLines(dataFiles_arry[1]) -- чтение данных из первого найденного .txt в массив из строк
str_arry = #()
for d = 1 to dataRaw.count do
(
join str_arry (filterString dataRaw[d] ",") -- создание массива из строк, где "," разделитель между элементами массива
)
for j = 1 to str_arry.count do -- цикл для всех элементов прочитанного из .txt массива
(
kkVal = str_arry[j] as integer -- конвертация из строчного значение в целое число
proVal = 0

if kkVal == 95 then (kkVal = 5; proVal=1)
if kkVal == 97 then (kkVal = 7; proVal=1)
if kkVal == 98 then (kkVal = 8; proVal=1)

append kk kkVal -- присоединение значения к массиву kk
append pro proVal
)
)
--format "kk->%\n" kk
--format "pro->%\n" pro

newmat = multimaterial name:"MyMultiMat" numsubs: (999)
newmat[1].faceted = on
newmat[2].faceted = on
newmat[3].faceted = on
newmat[4].faceted = on
newmat[5].faceted = on
newmat[6].faceted = on
newmat[7].faceted = on
newmat[8].faceted = on
newmat[9].faceted = on
newmat[1].diffuse = (color 255 0 0)
newmat[2].diffuse = (color 0 255 0)
newmat[3].diffuse = (color 0 0 255)
newmat[4].diffuse = (color 180 100 0)
newmat[5].diffuse = (color 255 0 0)
newmat[6].diffuse = (color 255 0 255)
newmat[7].diffuse = (color 0 0 255)
newmat[8].diffuse = (color 0 255 0)
newmat[9].diffuse = (color 255 255 0)
angx=#(-10,0,0,-10,-10,-1,0,0,-10); angy=#(30,120,30,30,30,50,30,120,30); angz=#(-97,-120,60,-80,-97,-97,60,-120,-97)
dx=#(-1.5,-1,-1.6,-1.5,-1.5,-1.5,-1.6,-1,-1.5); dy=#(0,-0.5,-0.3,0,0,0,-0.3,-0.5,0); dz=#(-1.2,1,1.2,-1.2,-1.2,-1.2,1.2,1,-1.2)
--
angp=#()
angp[14]=0
angp[15]=0
angp[24]=0
angp[25]=0
angp[29]=0
angp[33]=0
angp[34]=0
angp[35]=0
angp[64]=0
angp[74]=0
angp[91]=0
angp[109]=0
angp[110]=0
angp[152]=0
angp[244]=0
angp[275]=0
angp[322]=0
angp[337]=0
angp[361]=0
angp[457]=0
angp[463]=0
angp[502]=0
angp[609]=0
angp[613]=0
angp[614]=0
angp[624]=0
angp[764]=0
angp[795]=0
angp[810]=0
angp[824]=0
angp[836]=0
peptide=box length:0.1 width:0.1 height:0.1 position:[0,0,-.5] wirecolor:[250,250,250]; Converttomesh peptide
peptide.material = newmat[1]

for k = 1 to kk.count-1 do
(
newmat[k].faceted = on
element = sphere radius:0.7 pos:[0,0,0]; Converttomesh element
element.material = newmat[kk[k]]
attach peptide element; peptide.pivot = [0,0,0]; move peptide [dx[kk[k]],dy[kk[k]],dz[kk[k]]]
rotate peptide angx[kk[k]] [1,0,0]; rotate peptide angy[kk[k]] [0,1,0]; rotate peptide angz[kk[k]] [0,0,1]
)
)

Результат его работы с конкретными входными данными:



Однако нужно доработать этот вариант или написать новый.

Упрощённый вариант строит модель из одинаковых элементов, а нужно из таких же, но с дополнениями. Дополнения (их 23, это радикалы аминокислот) в скрипте Дениса Савина есть, но сам скрипт сложный, поэтому написать новый, простой скрипт может оказаться проще, чем модифицировать сложный скрипт Дениса Савина. Подробности обсуждаются на форуме лаборатории Наномир: http://nanoworld.org.ru/topic/2219/

Работа может быть оплачена инвестором по стандартным расценкам. Короче, если Ваша цена устроит инвестора, то работаем.

Скрипт можно дописывать по частям, без напряга по времени. Оплата после каждого этапа модификации.

здесь есть Igorznaq
с ним пообщайся. Он здесь самый крутой кодер
еще на 3d center обитает джаман, тоже кодит

Благодарю! А как бы его пригласить в эту тему?

https://render.ru/xen/threads/kak-vraschat-poligon-vokrug-opredeljonnogo-rebra.178168/post-1277583
вот он. Можете в личку к нему

Благодарю!

А сформулированное ТЗ есть? Что на входе, что нужно получить?
На первый взгляд, задача не сложная…

На входе два файла в текстовом формате. Один - кодирующая нуклеотидная последовательность типа такой:

>VOAJ01024667.1:c2335584-2334658 Crocuta crocuta isolate KB4526 scaffold179, whole genome shotgun sequence
CCCAGGCCCAGCGCTGGCCCCGCTCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCC
CCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCAC
TCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCAC
TCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTC
ATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCC
TGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGC
CCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCC
CCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCC
CGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCC
CCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCA
CTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCA
CTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCT
CATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATCCTGGCCCCCCCCCCGCCCCCACTCACTCTCATC
CTGGCCCCNAGCCTGCG

Каждые три буквы этого файла обозначают аминокислоту, которая должна находиться в библиотеке внутри будущего скрипта. Такая библиотека уже есть в скрипте Дениса Савина.

Этот же входной файл обрабатывает отлаженная программа "Пикотех 2D" и сохраняет второй файл, который нужен для работы нашего скрипта. Он имеет такой вид:

1,1,1,1,7,5,95,7,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,
97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,
9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,
1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,
7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,
1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,5,7,7,97,1,1,1,1,1,9,7,
5,7,7,97,5,95,0,97,4,

Каждое число означает, на какой угол из таблицы нужно повернуть очередную аминокислоту перед тем, как присоединить к будущей модели белка.

Программа Пикотех 2D изображает эти варианты в виде цветной схемы:


Вариант 1 обозначен красным цветом. Это - альфа-спираль.

Наш скрипт должен построить 3D модель этой спирали и отработать остальные коды, разделенные запятыми.

Более подробно ТЗ сформулировано здесь: http://nanoworld.org.ru/topic/2219/

Тут надо определиться, имеет ли смысл модифицировать скрипт Дениса Савина, свежую версию которого я могу прислать Вам по почте. Она весит 150 килобайт. Или имеет смысл написать отдельный 3D модуль, который будет обрабатывать два входных файла, брать из собственной библиотеки модели аминокислот и соединять их в модель белка типа такой:



На самом деле визуализация не обязательна. Главное рассчитать координаты атомов и сохранить их в стандарте PDB, т.е. примерно в таком виде:



Это значит, что программу можно написать на любом языке программирования.

Визуализировать координаты может стандартный браузер белковых структур, например, Swiss Wiever:


Задачу можно решать по этапам. Сначала, например, перенести библиотеку аминокислот из скрипта Дениса Савина в наш скрипт. Потом написать его до уровня расчета координат. А потом уже доделать вывод PDB-файла. И соответственно оплата поэтапная.

Может быть имеет смысл обсудить ТЗ на форуме или в чате. В диалоге всё прояснится быстро

С уважением,

Стало немного понятней, но пока объём работ всё ещё не совсем ясен.

Если визуализация в 3ds Max не очень нужна, то выбор MAXScript для решения задачи кажется не лучшим решением, хотя и возможным. Просто, фактически, создание геометрии в 3ds Max никак не поможет решению основной задачи — формированию PDB-файла. При этом написание и отладка этой части скрипта, составит существенную часть всей работы…

Надо бы посмотреть, что собой представляет "библиотека аминокислот", и как данные из неё влияют на решение.

На данный момент мне кажется, что логичней решать данную задачу в виде самостоятельного приложения, например на C#, ну или в виде скрипта Python, не привязываясь к 3ds Max.

Можем пообщаться подробнее. Моя почта: LastJedi@ya.ru или Телеграм: @p_ky3