Есть два способа:
1)маска(лично мне он не нравится, долго и трудоемко)
2) Effect>Keying>Liner Color Keying
задаешь цвет который нужно "уволить" и перед тобой окрываются невиданные доселе горизонты!
Удачи...
Вообще-то с кеингом в АЕ всегда было прямо скажем - хреново.
Вот D.Fusion кеит изумительно... сволочь...
Терпеть не могу эту софтину, но неоспоримые ее преимущества готов признать легко.