Настрой сетку в Edit > Preferences <Ctrl> + <K> > Guidеs, Gris & Slices <Ctrl> + <6> — по умолчанию там сетка привязывается не к пикселам, а, кажется, к точкам (ед. изм. лин. разм., а не геом. об.) и дюймам. При разрешениях, кратных 72 ppi это не слишком заметно, но при других — как раз твой случай.