Попробуй сохранить проект как AAF.
В Премьере зайди во вкладку Project. Там есть такая фишка Export Project as AAF.
Потом попробуй импортнуть этот AAF в Афтер.
Кстати, у тебя какая карта захвата видео? Matrox?
Можно попробовать посчитать в этот формат (в смысле в формат той карты, которая у тебя стоит).
Я так чаще всего и делаю.
если ничего не выйдет тогда, можно еще исходники пересчитать в Virtual Dub в формат карты и заново намонтировать, потом АЕ точно все откроет.
Тебе кстати, обязательно, чтобы весь проект открывался или же тебе можно весь твой монтаж пересчитать и отдельную авишку кинуть в Афтер?