Полуавтоматом так:
1. Экспорт слоев в отдельные файлы (script > lyaers to files)
2. Выделяем все файлы и заталкиваем в Adobe Illustrator или Adobe Indesign
3. Нажимаем на кнопку distribute spacing (0)
(в AiCS4-5 есть еще опция Artboard to Selection, которая подгоняет размер документа к выделенному)