Экспорт в PDF/X-1a, потом из Acrobat-а Save as EPS, а потом, если нужны, таки, PDF-ы — прогнать EPS-ы через Distiller.
Кабы это была не Book, а одна публикация, то экспорт в EPS можно было бы сделать прямо из InD.
Во всех случаях EPS-файлы нумеруются автоматически.
