Это одна и та же сцена без изменений? Если да, то действительно баг. Шустренько проверь имена поверхностей. Наведи порядок в сцене. Если там всё ок, снеси и переназначь материалы. Для проверки - сделай экспорт 2 поверхностей без истории и назначь на них 2 простых шейдера... бардак в сцене просто.