Не помню, можно ли переменовывать маркеры в программе, если нет - придётся ручками править файл *.ma (он текстовый, не боись). Надо найти нужный маркер и изменить его имя на: null_<старое имя> - поставить null перед именем. Теперь если такой проект открыть в афтерах должен появиться нулевое слой, который движется как маркер.