Все зависит от операционки.даже если у тебя террабыйтные массивы. Ограничение есть на колличество файлов в директории, но какое!? - это на сайте системщиков надо задавать такие вопросы. Я как-то давно уже общался ради интереса с ребятами по этому вопросу(за кружкой пива), но держать в с воей голове абсолютно не нужные цифири, которые еще и меняются от ОС до другой ОС, нет надобности.
Вопрос также относится и к длине пути до файла.
Я стараюсь не давадить ситуацию до предела. Рендерить можно и в каталог D:\Film1\scen1\
А чтобы разбить длинную композицию в Render Queue, есть скрипт
Split Render.