Рендерь обычным макаром, а потом склеишь, прог делающих это до фига и больше.
Желательно, чтобы каждая твоя авишка была одинаково пожата(а лучше не пожата или последовательность картинок), имела бы одинаковое число кадров в секунду и т.д. тогда минимальные потери будут при пересжимании после сборки.