На тот случай если вопрос актуален.
1.Проверь наличие галки в RenderSetting->MR->Custom Entities -> Pass Custom Alpha если используешь специфические материалы
2.Переведи параметр материала Matte Opacity в ноль альфа обьекта которого не нужна
3.Попробуй отрубить Premultyply в настройках RenderSetting->MR->Primary Framebuffer