все дело в том что бридж сливает вершины а не еджи.. поэтому выбрать ейджи и мердж.. а вообще чтоб видеть не слитые ейджи зайди в перефернес - полигонс - поставить галочку бордер ейдж.. и значение ейдж вейт на 3... тоегда не слитые аджи будут выделяться жирным.
Ну судя по картинке там явно только закрыть дыру нужно было одним полигоном. У меня филхол никогда не глючил, по двойному клику выделить все ребра дыры и филхол.