Если при сохранении файла произошло что-то чрезвычайное типа пропадания питания, то все, прощай плод трудов. А когда пишутся два файла, то это происходит в разное время - один точно будет жив. Это, конечно, не часто бывает, но уж если случится, то в самое неподходящее время, как обычно. Единственное мелкое неудобство - программа немного "замирает" на время записи бэкапа, если объем большой.