Потому что трассируете Вы не контуры, а 16 цветное изображение, судя по скриншотам. У вас стоит режим отображения Outlines, который служит для визуализации намечаемых контуров разбиения оригинального изображения на сегменты. Чтобы видеть, как это будет напечатано, переключите вид на результат трассировки, и настройте параметры как нужно.