Я думаю, что это не глюк Illustratora, а проблема в шрифтах, так как их кирилизуют доморощенные мастера, у меня в основном лицензионные шрифты, и вот сними ни каких проблем нет, как только попадает конверченный начинаются проблемы. Такое ощущение, что сам Illustrator тестирует их на "вшивость"
На моей машине установлен 2000 Windows, замена в регистре помогла и для Photoshopa6.0(но не совсем), также решил проблему со шрифтами в InDesigne1.5 (полностью)и помогло в illustratore9.0, но тоже частично.
У меня такое ощущение, что проблема может заключатся, в том , что у меня на машине все лицензионные программы(графические), хотя известно, что многие Adobobe-кие пакеты не взламывают.
Хотя и не спорю, что это глюк самой программы, у меня дома, стоит тоже самое, но шрифты ведут себя иначе.
Самый проверенный способ(у меня) пользоваться только Type 1(ParaType97/98)