У меня таже фигня. Причем файлы с альфой записанные в xFrog (модели растений), на которых изображены листочки, прекрасно рендерятся так, что все кроме листьев - прозрачное. А попробовал сделать такую же текстурку в Photoshop - альфа не рендерится прозрачной.
