Это тоже не все так просто. Люди тратят много времени чтобы заниматся\знать каким образом происходит этот процесс.
ОБщее, статья 2010 года -
http://www.malbred.com/stereo-kino/praktika-montazha-stereofilmov.html
Теория о 3Д дисплеях -
http://www.malbred.com/zhelezo-dlya-vj/3d-displei.html
Почему 3Д контент нельзя делать не в программах не поддерживающих, так сказать "3D среду"
http://www.malbred.com/stereo-kino/kak-otlichit-3d-i-psevdo3d-anaglif.html
(Новые возможности коумоз прог не принимаются во внимание)
В Maya или в любом другом 3Д редакторе рендерим контент (секвенцией, не avi\mov и т д) либо стереокамерой либо двумя камерами, расстояние друг от друга должно быть примерно равно расстоянию между глаз
Ну а дальше полет фантазий. Где угодно и в чем угодно собираете изображение по определеным правилам для определенного формата 3Д, и выводите его в финальный формат для просмотра, типа Avi например. В инете есть вся инфа по этому.
ЗЫ
Как я понял, ваши знания поверхностны в этой сфере, поэтому если хотите сами заниматся этим начинайте с азов или же делайте заказ у профи. )